調剤薬局の税務は医療業界特有の計上方法などがあるため、複雑で難易度が高いです。


調剤薬局の税務・会計は税理士に外注することをおすすめします。外注することで申告のミスなどが起きづらくなり、意図しない脱税などのルール違反を防げます。
また面倒で複雑な作業から解放されることで本業に集中できます。
調剤薬局におすすめの税理士と選び方のコツを解説します。
見出し
- 1 調剤薬局が税理士と契約するメリット
- 2 税理士に依頼する内容別の費用相場
- 3 調剤薬局につよい税理士を選ぶポイント5つ
- 4 薬局におすすめの税理士① 調剤薬局専門の税理士
- 5 薬局におすすめの税理士② 薬剤師とのダブルライセンス所持者が所属
- 6 調剤薬局におすすめの税理士③ 医療業界での実績が豊富
- 7 調剤薬局におすすめの税理士④:融資成功率が高く資金調達サポートが充実している
- 8 調剤薬局におすすめの税理士⑤:開業支援・創業支援が充実している
- 9 調剤薬局におすすめの税理士⑥:記帳の丸投げ対応可能
- 10 調剤薬局におすすめの税理士⑦:全国どこでも対応可能
- 11 税務や会計は税理士に任せることで本業に集中できる
調剤薬局が税理士と契約するメリット
調剤薬局が税理士と契約するメリットは3つあります。
① 税務処理でミスが起こりにくくなる
税理士に依頼するメリットのうち、最も効果を実感できることは税務処理に関する事柄です。
所得税の確定申告の際に申告ミスが発生しづらくなることを期待して税理士との契約を検討する人は多いでしょう。税務のプロである税理士と契約をすれば、確定申告をはじめとした税務処理でミスが発生しづらくなります。
そのほかにも節税に関する相談や各種補助金や融資の提案など、税理士に相談できることは様々です。
② 税務調査対策ができる
所得税の確定申告で不備がないとしても、数年に1度程度の頻度で税務調査の対象になることが多いです。
税務調査というとなにか不正が疑われていて、その証拠を見つけるものと勘違いしてしまいがちですが、不備や不正がないことを示すこともできます。
税務調査では会社に関することをかなり詳細に調査されます。後ろめたい部分がないことを示すためにも、適切な対策が必要です。
税理士であれば税務調査で調べられることが多いことがらについても理解しているので、適切な対処が可能です。
国税庁OBが多数所属している税理士事務所や法人であれば、税務調査に立ち会ってもらうときにも安心できるでしょう。
③ 資金調達サポートが受けられ安定経営につながりやすい
調剤薬局に限った話ではありませんが、どれほど順調に見える企業であっても手元の資金に不安が生まれるものです。
薬局の場合は運用資金だけでなく、高価な機器の導入が必要になることが多いです。融資を検討することも多くなります。
融資を受けるためには銀行や公庫などに融資を申し込み、審査を受けます。このときに融資をしても問題ないと主張するために事業計画書の提出などをします。
融資成功率が高い税理士に依頼すれば、融資をしてもらえるような書類の作成サポート等を行ってもらえます。
税理士に依頼する内容別の費用相場
税理士へ支払う報酬の額は、内容によって相場の額が異なります。
依頼内容別に相場をご紹介します。
青色申告の代行
個人事業主として薬局を経営する場合、年に1回青色申告をする必要があります。
青色申告の代行は年間の売上額によって費用相場が変化します。
年間の売上 | 費用相場 |
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年間売上500万円以下 | 60,000~100,000円 |
年間売上500万~1,000万円以下 | 100,000~150,000円 |
年間売上1,000万~3,000万円以下 | 150,000~200,000円 |
年間売上3,000万円以上 | 200,000円~要見積もり |
記帳の丸投げ対応
記帳作業の代行のうち、領収書等を整理せずに事務所側に送付するだけで領収書等の整理・記帳作業を行ってくれるサービスを俗に「記帳の丸投げ」と言います。
作業量が多いため費用が高くなる傾向がありますが、仕分け作業は薬局側で行うなどの工夫次第で料金をある程度抑えることもできます。
年間売上 | 費用相場 |
---|---|
500万円未満 | 50,000~150,000円 |
500万円以上1,000万円以下 | 100,000~200,000円 |
1,000万円以上3,000万円以下 | 150,000~250,000円 |
3,000万円以上5,000万円以下 | 200,000~300,000円 |
5,000万円以上 | 要見積もり |
節税など税務相談
節税対策など、税務相談の料金は1時間単位で設定されていることが多いです。
税務相談の料金相場は1時間10,000円~です。
調剤薬局につよい税理士を選ぶポイント5つ
税理士と契約するときにはいくつか気を付けるべきポイントがあります。5つの判断基準を紹介するのでご確認ください。
① 調剤薬局との顧問契約数が多いか
調剤薬局は、保険診療などの関係で他の一般的な会社や組織とは異なるキャッシュフローをしています。
ほかにも薬局では薬の在庫をどのように計上するかなど、一見わかりづらい会計処理が発生します。
顧問契約を結ぶ場合は、薬局そのものとの顧問契約数が多くなくても、最低限医療業界に一定の知見がある税理士事務所と契約することをおすすめします。
注意が必要なのは保険診療による報酬入金までのタイムラグです。保険診療による収入は計算が面倒なうえ、苦手意識がある税理士も少なくありません。
調剤薬局や医療業界での顧問契約が多い税理士事務所であれば、医療業界特有の資金の流れにも問題なく対応できるでしょう。
② 仕訳を含め記帳作業の丸投げができるか
薬局では様々な種類の薬を仕入れて販売します。帳簿にはいつ、なにを、どの量仕入れたか、販売したかという情報を漏れなく記入する必要があります。
しかし薬局はやるべきことが多いため、毎日のこまめに記帳作業ができるとは限りません。また「記帳はしたものの正しく記帳できているか不安」という悩みを抱えてい人も多くいます。
そこで、税理士に記帳作業を代行してもらうことを選択肢に入れましょう。
追加料金を支払えば領収書の仕訳などの作業も含めて記帳作業を代行してもらえるため、経理作業を丸投げしたいと考えている場合は仕訳含む記帳代行の報酬額も忘れずにチェックしましょう。
③ 薬局経営に関する相談もできるか
税理士は税務に関する作業を代わりにやってくれる職業というイメージがありますが、資金繰りなど経営に関するコンサルティングをしてくれる事務所もあります。
薬局の経営に関する相談ができる税理士事務所はまだ数が多くありません。しかし一部の税理士は税理士と薬剤師資格のダブルライセンスを所有していたり、自身も薬局を経営しているなどの理由で薬局の経営コンサルが可能なことがあります。
④ 資金調達に長けているか
調剤薬局をはじめとした医業は、保険診療の関係で資金繰りの難易度が高い傾向があります。
手元に、自由に動かせる資金が少なくなった場合は融資を受けることを検討するでしょう。融資を受ける先は銀行や公庫をはじめ、複数あります。
融資の申し込みそのものは、必要書類を提出するのみなので難しいことはあまり多くありません。しかし必要書類の完成度次第では融資を断られてしまいます。
融資成功率が高い税理士に依頼すれば必要な時に必要なだけの資金を調達できる可能性が高くなります。中には融資成功率が90%以上の税理士事務所もあるので、融資に強いかどうかも判断材料になるでしょう。
⑤ 開業支援を受けられるか
新しく薬局を開業するときはやるべきことが数多くあります。事業計画を策定したり、スタッフを雇う場合は待遇や業務上の規約を決めたりする必要があります。
薬局開業時は、保健所への申請と検査、厚生局への申請など多くの申請作業が必要になります。働きながら独立・開業を考えているのであればスケジュール調整が特に重要です。
薬局の開業時に税理士が代行できる作業の範囲は限定的ではあるものの、税務や会計、資金繰りに関するサポートを受けられたらスムーズに開業できます。
薬局におすすめの税理士① 調剤薬局専門の税理士
事業所名 | 特徴 |
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新橋税理士法人 |
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川端税理士事務所 |
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税理士法人ハンズオン |
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- リモートでも充実のサポートを提供
- 手厚い改行サポートが高く評価されている
- Zoomでの打ち合わせが可能
新橋税理士法人は、調剤薬局専門の税理士です。
代表の親族には薬剤師が多く、薬局に合わせたサービスを提供している会計事務所がないことから、調剤薬局専門の事務所に舵を切りました。
freeeの導入支援や「ペイジー」による電子納税サポートなど、クラウドとインターネットバンキングを活用してIT化を推進させられます。
またビデオ通話やチャットツール等を活用することで、日本全国の調剤薬局に対応できる点が魅力的です。


- Chatwork等を活用し、気軽に相談可能
- freee、マネーフォワード、弥生会計オンライン等のクラウド会計ソフトに対応
- オンラインツールの活用により全国対応可能
川端税理士事務所は、東京都千代田区に拠点を置く調剤薬局専門の税理士事務所です。
最寄り駅は東京メトロ日比谷線「秋葉原駅」や「JR秋葉原駅」です。「秋葉原周辺で税理士を探しているならおすすめの税理士」という口コミも見受けられます。
調剤薬局のほかにも、動物病院、歯科、システムエンジニア・IT系の合計4業種については専門の税理士チームがいる専門性の高い事務所です。
税理士顧問は対面とオンラインのどちらであっても可能です。これにより日本全国の調剤薬局に対応できます。
チャットワークやLINE、ZOOM、GoogleMeetなどの各種ツールを活用した綿密で質の高いサポートをしています。


- 法人、個人問わず月額28,500円からサポート
- 税務相談や記帳代行などサポート内容も充実
- ウェブツールを活用し全国対応可能
税理士法人ハンズオンは、東京都千代田区に拠点を置く調剤薬局専門の税理士法人です。
ZoomやLINE、Chatworkなど各種ウェブツールを活用して全国対応可能で、東京都、神奈川、埼玉県、千葉県など関東南部のエリアであれば訪問によるサポートも受け付けています。
毎月領収書や経費の詳細を郵送するだけで記帳代行もしてもらえるため、ややこしい税務・会計作業から解放され本業に集中できます。
薬局におすすめの税理士② 薬剤師とのダブルライセンス所持者が所属
事業所名 | 特徴 |
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市川秀 |
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- Xやnoteなどで積極的に情報発信をしている
- オンラインでのサポートに定評がある
- 薬剤師と税理士のダブルライセンス取得者
市川秀氏は、東京都国分寺市に拠点を置くアシタエ税理士法人に所属しています。税理士と薬剤師のダブルライセンスを所有しており、X(旧Twitter)などのSNSでも活発に発信しています。
調剤薬局におすすめの税理士③ 医療業界での実績が豊富
事業所名 | 特徴 |
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村中公認会計士税理士事務所 |
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会計事務所シンクロス |
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クイノス総合会計事務所 |
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金杉浩道税理士事務所 |
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- 薬局関係の業務実績が豊富
- 中小企業診断士も所属
- 顧問料が月額11,000円~とリーズナブル
村中公認会計士税理士事務所は、千葉県千葉市に拠点を置く税理士事務所です。
税務申告・決算書の作成から節税までトータルサポート可能で、薬局経営の心強いパートナーとなるでしょう。
また開業・会社設立支援も行っているため、開業前から依頼をしていれば不安定になりがちな開業直後の経営もうまく軌道に乗せられます。
村中公認会計士税理士事務所には中小企業診断士の有資格者が在籍しており、マーケティングコンサルを請け負っています。経営に関する悩み事があるのなら相談をおすすめします。

- 薬局・医療関係をはじめ小売業からクリエーターまで幅広く対応
- デジタル化支援で業務の効率化をサポート
- 丁寧親切、レスポンスが速いと口コミで評判
会計事務所シンクロスは、大阪府大阪市に拠点を置く会計事務所です。
日本全国の会計士が加入するTKC全国会の会員であり、TKC全国会の基本理念に則ったきめこまやかな質の高いサービスを提供しています。
近年の社会情勢の変化により、税理士業もオンラインやリモートで完結させる事務所が増えていますが、会計事務所シンクロスでは顧問先を毎月訪問し、巡回監査を実施しています。
また経営革新等支援機関にも認定されており、中小企業のサポートにも長けている会計事務所です。

- 名古屋と東京を中心に日本全国にサービスを提供
- 経理・財務等のあらゆる業務のサポートが可能
- 少数精鋭チームでコストカットを実現
クイノス総合会計事務所は、愛知県名古屋市に拠点を置く会計事務所です。
名古屋と東京を中心に、全国からの依頼を受け付けている会計事務所で、リモートでのサポートが原則となります。
現在までに全国100社以上のクライアントにサービスに提供してきた実績があります。その中には調剤薬局もあるため、薬局業務に関する一定以上の理解があると判断できます。
freeeやマネーフォワードなどのクラウド会計ソフトを利用して業務を行っているので、すでにクラウド会計ソフトを利用している人はもちろんのこと、これから導入するという人にもおすすめの会計事務所です。

- 医療法人への移行サポートもできる
- お客様対応はすべて税理士が担当
- 開業医や歯科医師など、医業への対応実績多数
金杉浩道税理士事務所は、東京都多摩市に拠点を置く税理士事務所です。
対応エリアは東京都、神奈川県、埼玉県と幅広く、特に多摩市、府中市、立川市、国立市、八王子市、町田市、川崎市、稲城市に力を入れています。
代表は都内の会計事務所で20年以上の実績があり、経営のアドバイスや税金の相談のみならず、資金調達や事業継承にも明るい、医業に携わる人にとって魅力的な税理士です。
また、税理士はサービス業であると認識し、お客様ファーストをモットーに活動をしています。税金に関する説明なども、専門用語はなるべく用いずに分かりやすくかみ砕いて説明してくれます。税務の知識がまったくない方でも安心して依頼ができる税理士事務所です。
調剤薬局におすすめの税理士④:融資成功率が高く資金調達サポートが充実している
事業所名 | 特徴 |
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いなほ会計 |
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大嶽公認会計士・税理士事務所 |
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上村竜也(税理士法人クリアレスト代表) |
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中岡康一税理士事務所 |
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- 無料で創業融資を行ってくれる
- 「コンサル型税務顧問」が顧客からも高評価を得ている
- 弥生会計プロフェッショナルアドバイザー
いなほ会計は、東京都文京区に拠点を置く税理士事務所です。
創業融資にも強いため、開業時からお世話になれます。融資は調達金の数パーセントが報酬になるケースが多いですが、いなほ会計では創業融資を無料で行ってくれます。
創業融資成功率が90%以上と非常に高く、「薬局を開業したいけれど資金面で心配」という方に特におすすめの税理士事務所です。
代表はITベンチャー企業の取締役の経験があり、中小企業ならではの経営の悩みにも寄り添ってくれると好評です。

- 資金調達やM&A支援もできる
- マネーフォワード・freee・弥生会計の3会計ソフトに対応
- 全社員が公認会計士・税理士資格を保有をしており品質の高いサービスを受けられる
上村竜也氏は税理士法人クリアレストの代表です。大手監査法人で上場企業の監査やIPO支援を経験し、専門性が高く難易度が高い依頼にも対応できる税理士です。
税理士法人クリアレストは東京都港区に拠点を置いています。資金調達においては事業計画の策定サポートを行ってくれます。
「難解な税務をクリアに」をモットーに親切丁寧に解説してくれるので、「税務は税理士にお任せしたいけど税務会計に関する知識をつけたい」と考える事業者におすすめです。

中岡康一税理士事務所
- 医療関係者の税務会計に注力
- 公的融資の融資実施成功率は95%以上
- 経験年数20年以上の実績がある税理士事務所
中岡康一税理士事務所は、埼玉県さいたま市に拠点を置く税理士事務所です。スタッフ数3人と小規模な事務所ですが、公的融資の融資実施成功率が95%以上と非常に高く、能力の高いスタッフが集まっていることがわかります。
税務の範囲を超えてサポートできるのも特徴の1つです。弁護士や社会保険労務士との強固な連携関係を築いており、なんからのトラブルが発生した際は提携先とのネットワークを用いた連携により迅速に解決できます。
ほかにも税務調査の立ち合いにも対応しており、税務調査の対象になった際に何をすればわからないと不安の方も安心できます。予約をすれば土日対応もできるので、平日は忙しい方でも利用しやすいでしょう。
調剤薬局におすすめの税理士⑤:開業支援・創業支援が充実している
事業所名 | 特徴 |
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千代田創業支援パートナーズ |
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吉田公認会計士事務所 |
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中江会計事務所 |
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- 創業支援と黒字戦略に特化している
- 融資成功の実績多数で金融機関の紹介も可能
- 質問・相談はオンラインを活用し全国に対応できる
千代田創業支援パートナーズは、東京都千代田区に拠点を置く税理士事務所です。
「創業・企業支援パック」や「融資支援サポート」など、複数のサービスをひとつにまとめたプラン例を明示しており、これから創業する人はもちろんのこと、費用面に懸念を感じている人も利用しやすい事務所です。
料金形態はおおまかに「税務顧問プラン」と「申告のみプラン」の2プランに分かれています。融資の相談などを本格的にしたいのであれば「税務顧問プラン」で依頼をしましょう。
クラウド会計にも精通しており、導入支援を含め経理の手間を大幅に下げられる点も魅力的なポイントといえます。

- M&Aの実績豊富で、買収・売却から財務デューデリジェンスまで一貫してサポートを受けられる
- 事業承継に強みを持っているから、税理士の経歴を重視したい方も安心
- 監査法人・税理士法人で25年の経験を持ったベテランなので、専門性の高いアドバイスをもらえる
- 会社設立・起業開業支援に自信あり
- 口コミでは人当たりの良さや丁寧な説明に高評価を受けている
- 日中対応可能でグローバルな事業展開にも強い
中江会計事務所は東京都江東区に拠点を置く会計事務所です。税務・会計のプロとして、顧客の事業成功のために伴奏するパートナーとして活躍してくれます。
代表は公認会計士として大手監査法人へ7年間務めた経験があります。その間に会計、監査、税務及びアドバイザリー業務を経験し、幅広いサポートができます。また中国語も堪能で日中対応可能な点も魅力的です。
専門知識の押し付けではなく、「わかりやすさ」と「親しみやすさ」を大切にし、税務に関する難しいことがらもわかりやすく説明してくれる点も口コミで高く評価されています。
調剤薬局におすすめの税理士⑥:記帳の丸投げ対応可能
事業所名 | 特徴 |
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メーティス税理士法人 |
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@TAX(アットタックス) |
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- 経理丸投げプランにより本業に集中できる
- 経理丸投げプランなら会計ソフトの契約不要
- 300社以上の実績がある
メーティス税理士法人は、大阪府岸和田市に拠点を置く税理士法人です。
経理業務の効率化サポートに強みがあり、証票書類の電子化の促進や電子申告・納税サポートなどを得意としています。
経理丸投げプランもあり、経理作業を委託することで本業に集中することもできます。
また税理士だけではなく、弁護士や社労士、司法書士など他士業との連携も可能です。そのほかにもSNSマーケティングをはじめとしたウェブ戦略の専門家とも連携ができるため、集客に悩んでいる人にもおすすめの税理士法人です。


- 領収書整理不要で丸投げ記帳ができる
- 専門スタッフによるサポートが随時受けられる
- 日本全国に対応できる
@TAX(アットタックス)は、東京都千代田区に拠点を置く税理士事務所です。
特徴は、専用の封筒に領収書を入れて送るだけで記帳をしてもらえる「経理丸投げサービス」を提供していることです。
多くの税理士事務所では、記帳代行を丸投げする場合も領収書の整理は自社でやる必要があります。しかし「経理丸投げサービス」では、領収書を整理・仕訳をしないで専用の封筒に入れて送るだけで記帳を代行してもらえます。送料も無料なので、手間とコストを大幅ダウンできると人気のサービスです。
「経理丸投げサービス」は、基本料金に含まれているサービスなので、低コストで面倒な経理作業から解放されます。
調剤薬局におすすめの税理士⑦:全国どこでも対応可能
事業所名 | 特徴 |
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田中慧税理士事務所 |
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香西税理士・行政書士事務所 |
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スターティン会計事務所 |
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- 30代と若く有望な税理士が代表
- 誠実で丁寧な対応が高評価を受けている
- 質問に対するレスポンスの速さも魅力
田中慧税理士事務所は、東京都練馬区に拠点を置く税理事務所です。
法人顧問業務を中心に行っており、日本国内であれば全国対応可能な点が魅力です。
代表は、平均年齢60歳を超えている税理士業界では珍しい30代の税理士で、経験豊富で将来有望な税理士です。どのような依頼も誠実に対応し、丁寧な対応を口コミでも高く評価されています。

- freee、マネーフォワードなどのクラウド会計に対応
- 代表税理士が責任をもって対応
- 「分かりやすく」「丁寧に」をモットーに顧客対応をしている
香西税理士・行政書士事務所は、神奈川県鎌倉市に拠点を置く税理事務所です。
事業規模が小さいスモールビジネスのサポートに長けており、月次決算報告書を活用した経営分析や融資などの資金繰りなど、安定経営を行うための支援が充実しています。
代表税理士が責任をもって顧客対応を行っているため、税務・会計だけではなく相続や建設業許可など、様々ことを幅広く相談できます。

スターティン会計事務所
- 小規模ビジネスのサポートに向いている
- ZoomやGoogleMeetを活用し全国対応可能
- ウェブツールを活用したクイックレスポンスが魅力
スターティン会計事務所は、東京都新宿区に拠点を置く会計事務所です。
起業家やスモールビジネス、スタートアップ企業など小規模ビジネスのサポートに向いた事務所です。
会計ソフトはfreeeやマネーフォワードに対応しているので、現在会計ソフトを使用している人はもちろんのこと、これから会計ソフトを使いたいという人にもおすすめです。
会計ソフト等を活用して全国対応可能なのも魅力的です。
税務や会計は税理士に任せることで本業に集中できる
薬剤師はやるべきことが多く、多忙な職業です。薬局を経営している場合は税務や会計、労務などの業務も発生します。
税理士など外部の人に委託できることはなるべく任せることで作業量を減らし、本業に集中できるようになります。
ただし薬局や医療業界について一定の知識がない税理士に依頼をするとかえって手間が増えるリスクがああります。
依頼する税理士を選ぶときは必ず複数の税理士事務所から見積もりを取り、比較するようにしましょう。